freesurfer对结构像分割流程及批处理代码
freesurfer对结构像分割流程及批处理代码
- 概述
- freesurfer对结构像分割流程
- freesurfer批处理代码
- recon-all 并行运行
概述
FreeSurfer 是一个能够分析结构 MRI 图像的软件。换句话说，您可以使用 FreeSurfer 来量化大脑特定区域的灰质和白质的数量。 您还可以计算不同组织类型的皮层厚度、曲率和灰质体积，表面积等测量值。
freesurfer对结构像分割流程
下面给出freesurfer批处理流程：
freesurfer批处理代码
下面给出批处理代码，核心命令recon-all.
#!/bin/bashexport SUBJECTS_DIR=/home/xiaoming/document/T1wprogram/recon_all_T1wT1wdata=/home/xiaoming/document/T1wprogra