如何提取fMRI的时间序列,以及构建功能连接矩阵(functional connectivity)
如何提取fMRI的时间序列,以及构建功能连接矩阵
- 概述
- 空间距离上脑区的神经事件的时间相关性
- 如何提取fMRI的时间序列,以及构建功能连接矩阵
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- 读取解剖模板
- 读取每个被试预处理好的4D nii文件
- 提取时间序列和计算功能连接corr
- 完整代码
概述
上图说明了在图论分析中从fMRI中提取复杂网络的主要步骤。
步骤一: 对采集的功能磁共振成像数据进行许多预处理步骤,包括切片之间的时间校正、重新对准、图像配准、基于分割的归一化和空间平滑。需要注意的是预处理步骤的选择和顺序可能会影响最终图指标测量的范围。
预处理步骤可以参考:DPABI详细使用教材——数据准备、预处理流程、数据分析流程
步骤二: 为了探索大规模的大脑网络,应用了适当的分割方案,例如解剖学自动标记图谱,将整个大脑划分为几个皮质和皮质下的解剖单元。
步骤三