R语言绘图——组间差异箱线图图,小提琴图、聚类热力图、相关系数热力图
生物医学工程常用图
- 箱线图:使用ggboxplot()函数来展示数据在多组间的差异
- 小提琴图:使用ggviolin()函数来展示数据在多组间的比较
- 热力图:pheatmap()展示聚类热图反映数据在多样本间的差异表达情况
- 相关系数热力图:corrplot绘制相关系数图来展示数据间的相关性~
- 相关性分析图:ggMarginal()绘制相关性分析图
注:本文摘自于公众号:科研生信充电宝,R语言50绘图|50期R语言绘图汇总大合集
箱线图:使用ggboxplot()函数来展示数据在多组间的差异
在做图时:
一般需要根据及以表达结果提取三列信息:
① Type: 样本类型
用作——展示在我们的X轴
用作——展示在我们的颜色填充分组
② Expression:数据大小
用作——展示在我们的Y轴
例子:根据基因在多组间的差异表达结果,使用箱线图进行展示。
① 设置目录:
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